------------------------------------------------------------------------------ SWISS-PROT Protein Sequence Data Bank. Release 36.0, July 1998 ------------------------------------------------------------------------------ Yeast Chromosome VIII entries ------------------------------------------------------------------------------ Amos Bairoch Email: bairoch@medecine.unige.ch Swiss Institute of Bioinformatics and University of Geneva Switzerland ------------------------------------------------------------------------------ Document name: YEAST8.TXT ------------------------------------------------------------------------------ ========================================= Yeast chromosome VIII open reading frames ========================================= The complete DNA sequence of chromosome VIII of the yeast S.cerevisiae has been determined by the Genome sequencing Center and Department of Genetics of Washinton University in St. Louis, U.S.A. See: Johnston M., et al. Science 265:2077-2082(1994). Size of CHRVIII: 589 Kb Total number of ORFs currently in SWISS-PROT: 268 ===================== ORF code nomenclature ===================== YX[L|R]ddd[w|c] Y = Yeast X = Letter representing the chromosome (in this case X is 'H' for CHRVIII) L | R = 'L' is for Left arm; 'R' is for Right arm ddd = ORF number on the left or right arm c | w = 'c' is for complementary strand; 'w' is for Watson strand ================== Categories of ORFs ================== 1: genetically and biochemically characterized 2: genetically characterized, but exact function not known 3: high similarity to a protein of characterized function 4: high similarity to a protein of uncharacterized function 5: low similarity to an existing protein 6: no known similarity (temporary assignment) 7: probable non-expressed ORF ---------- ---------- ------ ---- ------------------- --------------- ---- ORF SWISS-PROT S-PROT Size Gene name and ORF code Cat. code entry name AC a.a. synonyms synonyms ---------- ---------- ------ ---- ------------------- --------------- ---- YHL050c YHF0_YEAST P38721 697 4 YHL049c YHE9_YEAST P38722 271 6 YHL048w YHE8_YEAST P38723 381 4 YHL047c YHE7_YEAST P38724 637 4 YHL046c YHE6_YEAST P38725 120 4 YHL045w YHE5_YEAST P38726 115 4 YHL044w YHE4_YEAST P38727 235 4 YHL043w YHE3_YEAST P38728 170 6 YHL042w YHE2_YEAST P38729 150 6 YHL041w YHE1_YEAST P38730 149 6 YHL040c YHE0_YEAST P38731 627 4 YHL039w YHD9_YEAST P38732 585 6 YHL038c CBP2_YEAST P03874 630 CBP2 2 YHL037c YHD7_YEAST P38733 159 6 YHL036w YHD6_YEAST P38734 546 5 YHL035c YHD5_YEAST P38735 1592 3 YHL034c SSB1_YEAST P10080 294 SSBR1; SSB1 1 YHL033c RL4A_YEAST P17076 256 RPL4A; MAK7 1 YHL032c GLPK_YEAST P32190 709 GUT1 1 YHL031c YHD1_YEAST P38736 223 4 YHL030w YHD0_YEAST P38737 1868 6 YHL029c YHC9_YEAST P38738 679 6 YHL028w YHC8_YEAST P38739 605 6 YHL027w R101_YEAST P33400 625 RIM101; RIM1 1 YHL026c YHC6_YEAST P38740 268 6 YHL025w SNF6_YEAST P18888 332 SNF6 2 YHL024w YHC4_YEAST P38741 713 4 YHL023c YHC3_YEAST P38742 1146 6 YHL022c SP11_YEAST P23179 398 SPO11 2 YHL021c YHC1_YEAST P23180 465 6 YHL020c OPI1_YEAST P21957 404 OPI1 1 YHL019c APM2_YEAST P38700 605 APM2 1 YHL018w YHB8_YEAST P38744 120 3 YHL017w YHB7_YEAST P38745 532 4 YHL016c DUR3_YEAST P33413 735 DUR3 1 YHL015w RSU2_YEAST P38701 121 URP2 1 YHL014c YLF2_YEAST P38746 405 YLF2 2 YHL013c YHB3_YEAST P38747 307 6 YHL012w UDPH_YEAST P38709 493 3 YHL011c KPR3_YEAST P38689 320 PRPS3; PRS3 1 YHL010c YHB0_YEAST P38748 585 4 YHL009c YHA9_YEAST P38749 330 5 YHL008c YHA8_YEAST P38750 627 3 YHL007c ST20_YEAST Q03497 939 STE20 1 YHL006c YHA6_YEAST P38751 159 6 YHL005c YHA5_YEAST P38752 130 6 YHL004w RT04_YEAST P32902 394 MRP4 1 YHL003c LAG1_YEAST P38703 411 LAG1 1 YHL002w YHA2_YEAST P38753 452 5 YHL001w R14B_YEAST P38754 138 RPL14B 1 YHR001w YHG1_YEAST P38755 437 4 YHR002w YHG2_YEAST P38702 357 3 YHR003c YHG3_YEAST P38756 429 4 YHR004c YHG4_YEAST P38757 446 6 YHR005c GBA1_YEAST P08539 472 GPA1; SCG1; CDC70; 1 DAC1 YHR006w YHG6_YEAST P38704 541 4 YHR007c CP51_YEAST P10614 530 ERG11; CYP51; 14DM 1 YHR008c SODM_YEAST P00447 233 SOD2 1 YHR009c YHG9_YEAST P38758 518 4 YHR010w RL27_YEAST P38706 136 RPL27A; RPL27 1 YHR011w YHH1_YEAST P38705 446 3 YHR012w PE11_YEAST P38759 282 PEP11 2 YHR013c ARD1_YEAST P07347 238 ARD1 1 YHR014w SP13_YEAST P23624 291 SPO13 2 YHR015w YHH5_YEAST P38760 659 3 YHR016c YHH6_YEAST P32793 382 YSC84 4 YHR017w YHH7_YEAST P32792 385 YSC83 6 YHR018c ARLY_YEAST P04076 463 ARG4 1 YHR019c SYNC_YEAST P38707 554 DED81 1 YHR020w YHI0_YEAST P38708 688 3 YHR021c R272_YEAST P38711 82 RPS27B 1 YHR022c YHI2_YEAST P38763 256 5 YHR023w MYS1_YEAST P08964 1928 MYO1 1 YHR024c MPP1_YEAST P11914 482 MAS2; MIF2 1 YHR025w KHSE_YEAST P17423 357 THR1 1 YHR026w PPA1_YEAST P23968 213 PPA1 1 YHR027c YHI7_YEAST P38764 993 3 YHR028c DAP2_YEAST P18962 818 DAP2 1 YHR029c YHI9_YEAST P38765 294 5 YHR030c SLT2_YEAST Q00772 484 SLT2; MPK1 1 YHR031c YHJ1_YEAST P38766 723 3 YHR032w YHJ2_YEAST P38767 581 4 YHR033w YHJ3_YEAST P38690 423 3 YHR034c YHJ4_YEAST P38768 344 6 YHR035w YHJ5_YEAST P38769 630 5 YHR036w YHJ6_YEAST P38770 471 5 YHR037w PUT2_YEAST P07275 575 PUT2 1 YHR038w YHJ8_YEAST P38771 230 3 YHR039c YHJ9_YEAST P38694 644 3 YHR039Bc VATG_YEAST P48836 114 VMA10 1 YHR040w YHK0_YEAST P38772 366 5 YHR041c SRB2_YEAST P34162 210 SRB2 1 YHR042w NCPR_YEAST P16603 691 NCP1; NCPR1; PRD1 1 YHR043c DOG2_YEAST P38773 246 DOG2 1 YHR044c DOG1_YEAST P38774 246 DOG1 1 YHR045w YHK5_YEAST P38775 560 6 YHR046c YHK6_YEAST P38710 295 3 YHR047c AAP1_YEAST P37898 856 AAP1 1 YHR048w YHK8_YEAST P38776 514 5 YHR049w YHK9_YEAST P38777 243 6 YHR050w SMF2_YEAST P38778 549 SMF2 2 YHR051w COX6_YEAST P00427 148 COX6 1 YHR052w YHL2_YEAST P38779 376 6 YHR053c MTC_YEAST P07215 61 CUP1; MTH1 YHR055c 1 YHR054c YHL4_YEAST P38780 354 4 YHR056c YHL6_YEAST P38781 883 3 YHR057c CYPB_YEAST P23285 205 CPR2; CYP2; SCC2; 1 CRG YHR058c MED6_YEAST P38782 295 MED6 2 YHR059w YHL9_YEAST P38783 130 6 YHR060w VM22_YEAST P38784 181 VMA22 2 YHR061c YHM1_YEAST P38785 314 6 YHR062c YHM2_YEAST P38786 293 6 YHR063c YHM3_YEAST P38787 379 6 YHR064c YHM4_YEAST P38788 572 3 YHR065c RRP3_YEAST P38712 543 RRP3 1 YHR066w SSF1_YEAST P38789 453 SSF1 2 YHR067w YHM7_YEAST P38790 280 6 YHR068w DHYS_YEAST P38791 387 DYS1 1 YHR069c YHM9_YEAST P38792 359 4 YHR070w YHN0_YEAST P38793 499 5 YHR071w YHN1_YEAST P38794 229 3 YHR072w ERG7_YEAST P38604 731 ERG7 1 YHR073w YHN3_YEAST P38713 996 4 YHR074w YHN4_YEAST P38795 714 5 YHR075c YHN5_YEAST P38796 400 6 YHR076w YHN6_YEAST P38797 374 5 YHR077c NMD2_YEAST P38798 1091 NMD2; UPF2; IFS1; SUA1 1 YHR078w YHN8_YEAST P38799 552 6 YHR079c IRE1_YEAST P32361 1115 IRE1; ERN1 1 YHR080c YHO0_YEAST P38800 1345 4 YHR081w YHO1_YEAST P38801 184 6 YHR082c KSP1_YEAST P38691 1029 KSP1 1 YHR083w YHO3_YEAST P14693 329 6 YHR084w ST12_YEAST P13574 688 STE12 1 YHR085w YHO5_YEAST P38803 334 6 YHR086w NAM8_YEAST Q00539 523 NAM8; MRE2 1 YHR087w YHO7_YEAST P38804 111 6 YHR088w YHO8_YEAST P38805 295 4 YHR089c GAR1_YEAST P28007 205 GAR1 1 YHR090c YHP0_YEAST P38806 282 5 YHR091c SYRM_YEAST P38714 643 MSR1 1 YHR092c HXT4_YEAST P32467 576 HXT4; LGT1; RAG1 1 YHR093w AHT1_YEAST P29589 182 AHT1 2 YHR094c HXT1_YEAST P32465 570 HXT1 1 YHR095w YHP5_YEAST P38808 144 6 YHR096c HXT5_YEAST P38695 592 HXT5 1 YHR097c YHP7_YEAST P38809 366 6 YHR098c YHP8_YEAST P38810 929 4 YHR099w YHP9_YEAST P38811 3744 3 YHR100c YHQ0_YEAST P38812 185 6 YHR101c YHQ1_YEAST P38813 335 6 YHR102w NRK1_YEAST P38692 1080 NRK1 1 YHR103w YHQ3_YEAST P38814 852 5 YHR104w YHQ4_YEAST P38715 327 3 YHR105w YHQ5_YEAST P38815 214 6 YHR106w YHQ6_YEAST P38816 342 3 YHR107c CC12_YEAST P32468 407 CDC12; CLA10; PSL7 1 YHR108w YHQ8_YEAST P38817 585 4 YHR109w YHQ9_YEAST P38818 585 6 YHR110w YHR0_YEAST P38819 212 3 YHR111w YHR1_YEAST P38820 440 3 YHR112c YHR2_YEAST P38716 378 3 YHR113w YHR3_YEAST P38821 490 3 YHR114w YHR4_YEAST P38822 633 5 YHR115c YHR5_YEAST P38823 416 4 YHR116w YHR6_YEAST P38824 151 6 YHR117w YHR7_YEAST P38825 639 3 YHR118c ORC6_YEAST P38826 435 ORC6; AAP1 1 YHR119w SET1_YEAST P38827 1080 SET1; YTX1 1 YHR120w MSH1_YEAST P25846 959 MSH1 1 YHR121w YHS1_YEAST P38828 187 6 YHR122w YHS2_YEAST P38829 231 6 YHR123w EPT1_YEAST P22140 391 EPT1 1 YHR124w NDT8_YEAST P38830 627 NDT80 2 YHR125w YHS5_YEAST P38831 101 6 YHR126c YHS6_YEAST P38832 159 4 YHR127w YHS7_YEAST P38833 243 6 YHR128w UPP_YEAST P18562 251 FUR1 1 YHR129c ARP1_YEAST P38696 384 ARP1; ACT5; ACT3 2 YHR130c YHT0_YEAST P38834 111 6 YHR131c YHT1_YEAST P38835 840 4 YHR132c YHT2_YEAST P38836 430 3 YHR133c YHT3_YEAST P38837 291 4 YHR134w YHT4_YEAST P38838 269 6 YHR135c CK11_YEAST P23291 538 YCK1; CKI2 1 YHR136c YHT6_YEAST P38839 148 6 YHR137w ARO9_YEAST P38840 513 ARO9 1 YHR138c YHT8_YEAST P38841 114 3 YHR139c SS10_YEAST P13130 326 SPS100 2 YHR140w YHU0_YEAST P38842 238 6 YHR141c RL44_YEAST P02405 106 RPL44B; RPL44; SCL41B; MAK18 1 YHR142w YHU2_YEAST P38843 316 6 YHR143w YHU3_YEAST P38844 325 6 YHR143Bw RPCX_YEAST P40422 70 RPC10; RPB12 1 YHR144c DCTD_YEAST P06773 312 DCD1 1 YHR146w YHU6_YEAST P38845 465 4 YHR147c RM06_YEAST P32904 214 MRPL6 1 YHR148w YHU8_YEAST P32899 183 3 YHR149c YHU9_YEAST P32900 734 4 YHR150w YHV0_YEAST P38848 579 6 YHR151c YHV1_YEAST P38849 526 6 YHR152w SP12_YEAST P17123 173 SPO12 2 YHR153c SP16_YEAST P17122 198 SPO16 2 YHR154w YHV4_YEAST P38850 1070 6 YHR155w YHV5_YEAST P38851 1228 4 YHR156c YHV6_YEAST P38852 340 6 YHR157w R104_YEAST P33323 182 REC104 2 YHR158c YHV8_YEAST P38853 1164 4 YHR159w YHV9_YEAST P38854 504 6 YHR160c YHW0_YEAST P38855 283 5 YHR161c YHW1_YEAST P38856 637 4 YHR162w YHW2_YEAST P38857 129 4 YHR163w SOL3_YEAST P38858 280 SOL3 2 YHR164c DNA2_YEAST P38859 1522 DNA2 1 YHR165c PR08_YEAST P33334 2413 PRP8; RNA8; DBF3 1 YHR166c CC23_YEAST P16522 626 CDC23 1 YHR168w YHW8_YEAST P38860 499 5 YHR169w DBP8_YEAST P38719 431 DBP8 2 YHR170w NMD3_YEAST P38861 518 NDM3 2 YHR171w YHX1_YEAST P38862 630 5 YHR172w YHX2_YEAST P38863 823 6 YHR173c YHX3_YEAST P38864 112 6 YHR174w ENO2_YEAST P00925 437 ENO2; ENOB 1 YHR175w YHX5_YEAST P38865 189 6 YHR176w YHX6_YEAST P38866 373 3 YHR177w YHX7_YEAST P38867 452 4 YHR178w STB5_YEAST P38699 743 STB5 2 YHR179w OYE2_YEAST Q03558 400 OYE2 1 YHR180w YHY0_YEAST P38868 163 6 YHR181w YHY1_YEAST P38869 228 6 YHR182w YHY2_YEAST P38870 785 6 YHR183w 6PG1_YEAST P38720 489 GND1 1 YHR184w YHY4_YEAST P38871 571 6 YHR185c YHY5_YEAST P38872 237 6 YHR186c YHY6_YEAST P38873 1541 6 YHR187w IKI1_YEAST P38874 309 IKI1 2 YHR188c YHY8_YEAST P38875 602 6 YHR189w PTH_YEAST P38876 190 3 YHR190w FDFT_YEAST P29704 444 ERG9 1 YHR191c CTF8_YEAST P38877 133 CTF8 2 YHR192w YHZ2_YEAST P38878 278 6 YHR193c EGD2_YEAST P38879 174 EGD2 2 YHR194w YHZ4_YEAST P38880 579 4 YHR195w YHZ5_YEAST P38881 321 6 YHR196w YHZ6_YEAST P38882 575 6 YHR197w YHZ7_YEAST P38883 763 6 YHR198c YHZ8_YEAST P38884 321 4 YHR199c YHZ9_YEAST P38885 310 4 YHR200w SUN1_YEAST P38886 268 SUN1 2 YHR201c PPX1_YEAST P38698 397 PPX1 1 YHR202w YH02_YEAST P38887 602 6 YHR203c RS4E_YEAST P05753 261 RPS7A 1 YHR204w YH04_YEAST P38888 796 5 YHR205w SCH9_YEAST P11792 823 SCH9; KOM1 1 YHR206w SKN7_YEAST P38889 622 SKN7; POS9; BRY1 1 YHR207c YH07_YEAST P38890 526 6 YHR208w BCA1_YEAST P38891 393 BAT1; TWT1 1 YHR209w YH09_YEAST P38892 291 4 YHR210c YH10_YEAST P38893 341 3 YHR211w FLO5_YEAST P38894 1075 FLO5 2 YHR212c YH12_YEAST P38895 111 4 YHR213w YH13_YEAST P38896 198 4 YHR214w YH14_YEAST P38897 203 6 YHR215w PPAC_YEAST P38693 467 PHO12 1 YHR216w IMH1_YEAST P38697 523 PUR5 1 YHR217c YH17_YEAST P38898 153 4 YHR218w YH18_YEAST P38899 603 6 YHR219w YH19_YEAST P38900 624 4